위험에 처한 공룡과 해양 동물을 구하기 위해 바다로 떠나는 고고다이노 대원들!
깊고 푸른 바다 속에서 예상치 못 한 사건들이 벌어지는데...
과연, 대원들은 바다 생태계를 무사히 지킬 수 있을까? 
고고다이노! 바다 생태계를 지켜라! 해양구조대 출동!